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設立宗旨 |
培育兼具生命科學及電腦資訊專長之大學生,使成為21世紀跨科技領域之生物資訊研發人才。 |
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成立年月 |
96年1月 |
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發展目標 |
1.初期:利用本校補助「生物資訊技術發展實驗室建置計畫」之經費80萬元,購置本實驗室之硬體及生物資訊課程所需之教學設備,並逐步建立及發展本領域之特色課程。 重要工作為:結合藥學系與生技系建立中草藥與化合物3D結構資料庫與藥物研發之虛擬篩選模式建置;並且建立網格計算之環境,作為生物資訊計算平台,加速虛擬篩選之進行,降低藥物合成與實驗之時間周期與成本。 2.中期:1.中草藥化學分子資料庫的建立,搜集傳統中草藥天然成分的化學結構與特徵,建立天然化合物資料庫作為藥物虛擬篩選之用。 2.結合農業生物科技園區之特色。 3.長期:配合政府「挑戰2008-國家重點發展計畫」與「兩兆雙星」產業發展計畫之重點推動項目生物資訊之領域,研究其相關技術及應用,諸如藥物研發、基因工程技術等。 |
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承接計畫 |
1.本校補助「生物資訊技術發展實驗室建置計畫」經費80萬元。 |
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參與教師 |
召集人:蘇順德。成員:(資工系)陳中亮、陳瑞樂;(藥學系)李冠漢;(生技系)王志傑;(職安系)馮靜安 |
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重要設備 |
一、 4個node 之PC叢集主機(PC cluster)。 二、 圖形工作站: IBM z-pro圖形工作站1台,SGI O2圖形工作站1台。 三、 彩色輸出設備 Hp2600n。立體眼鏡。 四、 藥物設計:Accelrys DS Modeling 1.7(教學用)。 五、 藥效團設計模擬:Accelrys 3DQSAR Catalyst 4.09。 六、 分子對接:DOCK , FlexX |
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課程規劃 |
化學、物理、生物、生物資訊概論、生物計算概論、演算法、資料庫系統。 |
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研究成果 |
(一)建立分子化合物資料庫共十一種,可供虛擬篩選之分子數目共計1,480,838筆。引入公用3D結構資料庫86,970,467筆。 (二)建立虛擬篩選系統網格計算環境架構進行UCSF DOCK分子對接計算。 (三)相關論文投稿發表 1. Jui-Le Chen,Bor-Ruey Huang,Kuan-Han Lee;” Global Grid Bond to the Local Parallel Processing for Virtual Screening “,Annual Chinese Chemical Society & ICCT 2007 Joint Conference(壁報論文)。 2. Jui-Le Chen,Bor-Ruey Huang,Kuan-Han Lee;”Global Grid Virtual Screening:Toward Maximum Computational efficiency of Docking Approach by Using Local Parallel Processing ”, 2007 Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Taiwan(壁報論文)。 |